Bupleurum lycaonicum snogerup bitki türünün DNA üzerine etkisi

Abstract

Özet Amaç Apiaceae familyası üyeleri, dünyada ekonomik öneme sahip bitki gruplarındandır. Bu çalışmada, Apiaceae familyasına ait çiçekli endemik bitki türü olan Bupleurum lycaonicum, bitki özütlerinin DNA üzerine etkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Bitki türlerinin DNA’ya bağlanma ve kesme mekanizması, etkili antitümör ilaç tasarlanmasında önemlidir. Bu tür ilaçların başarısı, DNA’ya olan ilgilerine ve bağlanma şekillerine göre belirlenir. Gereç-Yöntem Amacı gerçekleştirmek üzere, bitkinin metanol ve etanol özütleri çıkarılmıştır. Çıkarılan bu özütler, DMSO içerisinde 100 mg/mL konsantrasyonda çözülerek hazırlanmış ve özütlerin pBR322 plazmid DNA üzerinde etkisi, agaroz jel elektroforez yöntemi ile araştırılmıştır. Bu yöntemle, yüksek konsantrasyondan düşük konsantrasyona seyreltilerek hazırlanan bu özütler, pBR322 plazmid DNA ile 37°C’de 24, 48 ve 72 saat inkübe edilmiştir. Kontrol olarak özütler ile muamele edilmemiş pBR322 plazmid DNA’sı jeldeki birinci kuyucuğa konularak karşılaştırma yapılmıştır. Bulgular DNA-özüt karışımı, %1’lik agaroz jel elektroforezinde yürütülerek ultraviyole ışık altında fotoğrafları çekilmiştir. Böylece bitki özütlerinin DNA’ya bağlanma ve kesme aktivitesine bakılmıştır. Özütlerin DNA üzerinde hangi nükleotitlere bağlandığı restriksiyon endonükleaz enzimleri ile kesilerek belirlenmiştir. Elde edilen bulgular, bitki özütleriyle etkileşime girmiş DNA’nın, BamHI ve HindIII enzimleriyle inkübasyona bırakıldıktan sonra enzimlerin DNA’yı kesmediğini göstermiştir. Bu da, özütlerin DNA’sında Adenin-Adenin’in Guanin-Guanin’e bağlandığını gösterir. Bu bağlanma olduğu için enzimler DNA’yı kesememiştir. Sonuç-Öneri Elektroforez sonucu, plazmid DNA’nın üç farklı biçimi (Form I, Form II, Form III) ve bu formların jeldeki göç sırası gözlenmiştir. Elde edilen bulgular sonucunda da, bu bitkinin DNA ile etkileşime girme yeteneği potansiyel bir antikanser ajan olabileceği ihtimalini göstermektedir. Bu sebeple yapılacak ileri çalışmalarda da bu bitkinin çeşitli kanser hücre hatlarında sitotoksik etkilerinin araştırılması önerilmektedir.